Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms