Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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