Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms