Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snw1Q9CSN1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snw1Q9CSN1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms