Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029F12RikQ9CRB4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029F12RikQ9CRB4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms