Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msmo1Q9CRA4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msmo1Q9CRA4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms