Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3kQ9CQZ7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms