Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms