Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PsenenQ9CQR7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms