Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5f1Q9CQQ7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms