Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQM1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQM1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQM1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQM1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms