Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
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