Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms