Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudt21Q9CQF3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms