Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms