Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ70

H2afb1, Histone H2A-Bbd type 1, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb1Q9CQ70 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afb1Q9CQ70 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afb1Q9CQ70 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afb1Q9CQ70 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afb1Q9CQ70 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afb1Q9CQ70 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afb1Q9CQ70 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afb1Q9CQ70 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afb1Q9CQ70 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afb1Q9CQ70 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afb1Q9CQ70 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afb1Q9CQ70 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afb1Q9CQ70 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afb1Q9CQ70 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms