Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd2Q9CQ48 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms