Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms