Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sike1Q9CPR7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sike1Q9CPR7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms