Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2a1Q99PM3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms