Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rrbp1Q99PL5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrbp1Q99PL5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms