Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rassf3Q99P51 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms