Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms