Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms