Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp26Q99MX1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms