Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms