Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KarsQ99MN1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KarsQ99MN1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KarsQ99MN1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KarsQ99MN1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KarsQ99MN1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KarsQ99MN1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KarsQ99MN1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KarsQ99MN1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KarsQ99MN1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KarsQ99MN1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KarsQ99MN1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KarsQ99MN1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KarsQ99MN1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KarsQ99MN1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KarsQ99MN1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KarsQ99MN1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KarsQ99MN1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KarsQ99MN1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KarsQ99MN1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms