Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms