Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms