Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms