Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RtcbQ99LF4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms