Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nmd3Q99L48 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms