Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1aQ99L02 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms