Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TriobpQ99KW3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms