Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms