Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms