Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms