Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms