Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec3Q99J72 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms