Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms