Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Gtpbp3Q923K4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Gtpbp3Q923K4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Gtpbp3Q923K4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp3Q923K4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp3Q923K4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Gtpbp3Q923K4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp3Q923K4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp3Q923K4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp3Q923K4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp3Q923K4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp3Q923K4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp3Q923K4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtpbp3Q923K4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp3Q923K4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp3Q923K4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp3Q923K4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp3Q923K4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp3Q923K4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp3Q923K4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp3Q923K4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp3Q923K4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms