Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms