Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b3Q921M3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sf3b3Q921M3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms