Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms