Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Supt16hQ920B9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt16hQ920B9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt16hQ920B9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms