Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms