Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca5Q91ZW3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms