Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atl3Q91YH5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atl3Q91YH5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms