Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac11Q91WA3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac11Q91WA3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms