Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHT7

Gtf3a, Transcription factor IIIA, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3aQ8VHT7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3aQ8VHT7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms